回复：吉安应用工程学校的毕业证书与普通高中毕业证书的效力是不同的。吉安应用工程学校是一所职业学校，其毕业证书主要证明学生在某一职业技能方面的掌握程度，而普通高中毕业证书则代表学生完成了基础教育的学业。因此，两者的教育层次和证书效力是不同的。对于求职或升学，需要根据具体岗位或学校的要求来决定证书的适用性和效力。